При нарушении нормального режима работы АО «Аэропорт Якутск» из-за ограничений по технической возможности, предпочтение в обслуживании осуществляется в следующей очередности:
а) Рейсы, выполняемые по решению Правительства РФ, а также полеты выполняемые воздушными судами государственной авиации в интересах обороноспособности и безопасности государства; 
б) Пассажирские регулярные международные;
в) Пассажирские регулярные внутренние;
г) Пассажирские чартерные международные на регулярной основе;
д) Пассажирские чартерные внутренние на регулярной основе;
е) Пассажирские чартерные международные разовые;
ж) Пассажирские чартерные внутренние разовые;
з) Грузовые чартерные международные разовые;
и) Грузовые чартерные внутренние разовые;
к) Полеты авиации общего назначения